Gần 19.000 thường dân đã bị giết ở Iraq trong cuộc bạo lực liên quan đến ISIL từ tháng 1 năm 2014 đến tháng 10 năm 2015.[177] ISIL đã thực hiện cho 1.700 sĩ quan không quân Shia Iraq từ trại Speicher gần Tikrit vào ngày 12 tháng 6 năm 2014.[178] Việc diệt chủng Yazidis của ISIL đã dẫn đến việc trục xuất, bay và lưu vong hiệu quả của người Yazidi từ vùng đất tổ tiên của họ ở phía bắc Iraq.[179]

Theo Newsweek, Tổ chức Ân xá quốc tế tuyên bố rằng "lực lượng chính phủ Iraq và quân đội bán quân đã bị tra tấn, bắt bớ, cưỡng bức biến mất và hành quyết hàng ngàn thường dân đã trốn khỏi quy tắc của nhóm chiến binh Hồi giáo" [180]. Báo cáo có tựa là "Trừng phạt vì những tội ác của Daesh", cáo buộc hàng ngàn người đàn ông Sunni và các em trai đã bị lực lượng Iraq và các lực lượng chính phủ Iraq tiêu diệt.[181]